Основным направлением деятельности Центра квантовых технологий в области науки является исследование методов экспериментального контроля над квантовыми системами. Сотрудники центра занимаются разработкой прототипов квантовых устройств для секретной передачи информации и реализации алгоритмов квантовых вычислений. Также в центре проводятся исследования по разработке нанофотонных и одноатомных одноэлектронных устройств.